Fullmetal Alchemist Ultimate

Edward e Alphonse Elric sono due giovani fratelli che vivono nel paese di Amestris. Il loro padre, Hohenheim, ha lasciato la casa quando erano ancora piccoli, mentre alcuni anni più tardi la loro madre Trisha muore in seguito ad una malattia, lasciando i due orfani. I fratelli tentano allora, tramite un'arte chiamata alchimia, di riportarla in vita, ma la trasmutazione alchemica non procede come previsto e i due devono affrontare terribili conseguenze: Edward perde una gamba mentre Alphonse l'intero corpo. Per riportare l'anima di Alphonse nel mondo umano, Edward sacrifica il suo braccio destro per legare l'anima del fratello ad un'armatura e facendosi poi rimpiazzare gli arti perduti con delle protesi meccaniche chiamate automail.

Dopo la nomina di Edward ad Alchimista di Stato, i due fratelli iniziano un viaggio attraverso Amestris per cercare la pietra filosofale, un oggetto alchemico capace di annullare il principio dello scambio equivalente, e riottenere così i loro corpi originari. Durante il loro cammino, i fratelli Elric devono affrontare diversi avversari, tutti in qualche modo interessati alla pietra filosofale; tra di essi Scar, un sopravvissuto della guerra di Ishbar che trama vendetta contro gli alchimisti di stato per aver sterminato il suo popolo, e gli homunculi, un gruppo di creature dall'aspetto umano con forti capacità combattive e l'abilità di rigenerare le loro ferite grazie all'uso delle pietre filosofali.

Con il prosieguo delle loro indagini, Edward e Alphonse scoprono che Amestris è stata fondata proprio dagli homunculi e dal loro creatore, un essere conosciuto come Padre, i quali controllano in segreto l'esercito e hanno in progetto di utilizzare l'intera nazione come un cerchio alchemico e trasmutare Amestris in una pietra filosofale gigante. Scoperto il piano del Padre, i fratelli Elric, insieme ad alcuni membri dell'esercito e ad altri alleati incontrati durante il cammino, decidono di contrastarlo. Durante la battaglia finale, Alphonse si sacrifica per far riottenere ad Edward il braccio mancante, grazie al quale il ragazzo distrugge la pietra filosofale del Padre. Rinunciando per sempre all'uso dell'alchimia, Edward riesce a recuperare il fratello e i due riprendono la loro vita, decidendo di viaggiare per vedere il mondo e ottenere nuove conoscenze. Nell'epilogo, i due tornano infine a vivere a Resembool con Winry e May.